MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Buchnera aphidicola str. Tuc7 (Acyrthosiphon pisum) chromosome

Total Repeats: 3816

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011834	TAA	3	9	24	32	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_011834	ATT	3	9	38	46	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_011834	T	6	6	45	50	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_011834	T	8	8	52	59	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_011834	T	7	7	61	67	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_011834	AAAGA	2	10	81	90	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
7	NC_011834	T	8	8	99	106	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_011834	T	6	6	2100	2105	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_011834	T	6	6	2119	2124	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_011834	AAAATT	2	12	2135	2146	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_011834	ATA	2	6	2170	2175	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_011834	T	8	8	2226	2233	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_011834	T	6	6	2245	2250	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_011834	GA	3	6	2267	2272	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15	NC_011834	T	7	7	3115	3121	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_011834	T	7	7	3379	3385	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_011834	T	6	6	3393	3398	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_011834	A	6	6	3401	3406	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_011834	ATT	2	6	3410	3415	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_011834	ATT	2	6	3420	3425	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_011834	T	7	7	3442	3448	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_011834	AAT	3	9	4519	4527	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_011834	TAA	2	6	6078	6083	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_011834	TAG	2	6	6978	6983	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_011834	T	7	7	8395	8401	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_011834	AT	3	6	8413	8418	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_011834	AAT	2	6	8840	8845	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_011834	T	6	6	8859	8864	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_011834	A	6	6	8880	8885	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_011834	A	6	6	8900	8905	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_011834	T	7	7	11337	11343	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_011834	ATT	2	6	11354	11359	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_011834	ATT	2	6	11363	11368	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_011834	ATT	2	6	11371	11376	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_011834	A	7	7	11384	11390	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_011834	ATT	2	6	11401	11406	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_011834	ATT	2	6	11411	11416	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_011834	TAT	2	6	11417	11422	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_011834	CAAT	2	8	13938	13945	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
40	NC_011834	A	7	7	13946	13952	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_011834	AT	4	8	13993	14000	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_011834	TA	3	6	14006	14011	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_011834	T	8	8	14013	14020	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_011834	T	6	6	14034	14039	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_011834	ATATA	2	10	14086	14095	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_011834	T	6	6	14107	14112	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_011834	AAG	2	6	14118	14123	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_011834	A	7	7	14152	14158	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_011834	T	7	7	14194	14200	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_011834	T	6	6	14250	14255	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_011834	TAAA	2	8	14269	14276	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_011834	AAT	2	6	14299	14304	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_011834	TTA	2	6	14310	14315	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_011834	CAA	2	6	14340	14345	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_011834	A	6	6	14344	14349	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_011834	ATT	2	6	14532	14537	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_011834	T	7	7	14536	14542	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_011834	A	6	6	14543	14548	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_011834	A	11	11	14602	14612	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_011834	TTA	2	6	14647	14652	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_011834	A	6	6	14685	14690	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_011834	GA	3	6	14735	14740	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
63	NC_011834	TACAA	2	10	14753	14762	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
64	NC_011834	A	9	9	14793	14801	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_011834	ATA	2	6	14816	14821	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_011834	AAT	2	6	14826	14831	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_011834	ATT	2	6	14858	14863	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_011834	ATA	3	9	14868	14876	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_011834	T	6	6	14877	14882	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_011834	TA	3	6	14887	14892	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_011834	AAT	2	6	14927	14932	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_011834	AGT	2	6	14947	14952	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_011834	AT	4	8	16625	16632	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_011834	ACC	2	6	18047	18052	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
75	NC_011834	T	7	7	18101	18107	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_011834	ATC	2	6	18115	18120	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_011834	TGT	2	6	18131	18136	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_011834	T	6	6	18142	18147	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_011834	T	6	6	18158	18163	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_011834	ATATTT	2	12	18164	18175	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_011834	T	7	7	18181	18187	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_011834	A	8	8	18188	18195	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_011834	T	6	6	18200	18205	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_011834	TAAA	2	8	18232	18239	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_011834	A	7	7	18237	18243	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_011834	A	7	7	18245	18251	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_011834	TAA	2	6	18274	18279	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_011834	ATTAA	2	10	18310	18319	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_011834	A	6	6	18321	18326	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_011834	T	6	6	18330	18335	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_011834	AAT	2	6	18338	18343	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_011834	ATT	2	6	18352	18357	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_011834	TTTAT	2	10	20368	20377	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_011834	T	6	6	20383	20388	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_011834	T	6	6	20437	20442	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_011834	ATT	2	6	20462	20467	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_011834	AAAT	2	8	20477	20484	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_011834	TAA	2	6	20501	20506	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_011834	AAT	2	6	20515	20520	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_011834	AT	3	6	20543	20548	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_011834	A	9	9	20565	20573	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_011834	T	7	7	20582	20588	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_011834	TAT	2	6	20596	20601	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_011834	CAAT	2	8	20625	20632	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
105	NC_011834	T	6	6	20648	20653	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_011834	TCA	2	6	20670	20675	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_011834	TATTT	2	10	20681	20690	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_011834	T	7	7	20688	20694	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_011834	CAT	2	6	20704	20709	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_011834	TA	4	8	20754	20761	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_011834	ATC	2	6	20776	20781	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_011834	T	6	6	20791	20796	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_011834	T	7	7	20800	20806	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_011834	TA	3	6	20851	20856	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_011834	T	7	7	20861	20867	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_011834	ATT	2	6	20893	20898	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_011834	TA	3	6	20903	20908	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_011834	TACTT	2	10	20917	20926	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
119	NC_011834	TATAT	2	10	20933	20942	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_011834	AT	3	6	20955	20960	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_011834	T	7	7	21602	21608	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_011834	T	6	6	22869	22874	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_011834	TAT	2	6	22896	22901	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_011834	ATT	3	9	22922	22930	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_011834	ATTG	2	8	22934	22941	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
126	NC_011834	ATT	2	6	23529	23534	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_011834	AAC	2	6	23565	23570	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_011834	ATTTT	2	10	23582	23591	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_011834	T	6	6	23588	23593	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_011834	ATT	2	6	24796	24801	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_011834	TAAAAA	2	12	24803	24814	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_011834	T	6	6	24822	24827	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_011834	ATT	2	6	24843	24848	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_011834	T	6	6	24847	24852	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_011834	TTAA	2	8	24876	24883	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_011834	TA	3	6	24920	24925	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_011834	A	8	8	25827	25834	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_011834	T	6	6	25835	25840	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_011834	ATT	2	6	25848	25853	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_011834	TA	3	6	25854	25859	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_011834	ATTC	2	8	25879	25886	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
142	NC_011834	A	6	6	25887	25892	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_011834	T	9	9	25902	25910	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_011834	T	6	6	25924	25929	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_011834	TAA	2	6	25936	25941	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_011834	T	7	7	27789	27795	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_011834	A	6	6	27799	27804	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_011834	AATATA	2	12	27814	27825	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_011834	TAA	2	6	27832	27837	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_011834	T	7	7	29232	29238	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_011834	AT	3	6	29239	29244	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_011834	T	6	6	29244	29249	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_011834	ATTG	2	8	29264	29271	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
154	NC_011834	ATT	2	6	29275	29280	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
155	NC_011834	T	8	8	29279	29286	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
156	NC_011834	TTG	2	6	29297	29302	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
157	NC_011834	TAA	2	6	29323	29328	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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159	NC_011834	GTA	2	6	29361	29366	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
160	NC_011834	TAA	2	6	29371	29376	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
161	NC_011834	AT	3	6	29378	29383	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
162	NC_011834	T	6	6	29397	29402	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
163	NC_011834	AAG	2	6	30243	30248	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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165	NC_011834	ATT	2	6	30279	30284	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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173	NC_011834	A	6	6	30408	30413	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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181	NC_011834	A	8	8	30553	30560	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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192	NC_011834	TA	3	6	30823	30828	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
193	NC_011834	AT	3	6	30836	30841	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
194	NC_011834	GTA	2	6	30847	30852	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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295	NC_011834	CAG	2	6	48570	48575	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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454	NC_011834	A	7	7	82454	82460	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
455	NC_011834	TAA	2	6	82485	82490	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
456	NC_011834	ATAAA	2	10	82502	82511	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
457	NC_011834	A	14	14	82509	82522	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
458	NC_011834	TTA	2	6	82543	82548	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
459	NC_011834	T	7	7	82560	82566	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
460	NC_011834	A	6	6	82575	82580	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
461	NC_011834	TAC	2	6	82581	82586	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
462	NC_011834	A	9	9	82589	82597	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
463	NC_011834	AAT	2	6	82624	82629	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
464	NC_011834	ATA	2	6	83350	83355	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
465	NC_011834	A	6	6	83370	83375	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
466	NC_011834	A	6	6	83395	83400	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
467	NC_011834	T	6	6	85915	85920	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
468	NC_011834	TTA	2	6	85923	85928	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
469	NC_011834	AAT	2	6	85931	85936	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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471	NC_011834	TA	3	6	87030	87035	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
472	NC_011834	AT	3	6	87044	87049	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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481	NC_011834	A	6	6	87616	87621	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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483	NC_011834	A	6	6	87674	87679	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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486	NC_011834	TAAAAT	2	12	87734	87745	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
487	NC_011834	TAATA	2	10	87752	87761	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
488	NC_011834	AT	3	6	87765	87770	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
489	NC_011834	A	7	7	87784	87790	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
490	NC_011834	T	8	8	87817	87824	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
491	NC_011834	AT	3	6	87839	87844	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
492	NC_011834	TAT	2	6	87866	87871	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
493	NC_011834	AATT	2	8	87873	87880	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
494	NC_011834	TTTATA	2	12	87881	87892	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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497	NC_011834	ATT	2	6	91422	91427	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
498	NC_011834	TA	3	6	91429	91434	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
499	NC_011834	TAAA	2	8	91466	91473	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
500	NC_011834	GAA	2	6	91484	91489	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

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